正确答案 ：B

解析

本题考查行文方式。
联合行文是两个或两个以上的机关共同发文。甲市检察院、甲市法院和公安局是三个同级机关，共同制定了一份文件来明确刑事案件办理工作联系会议制度，所以是联合行文。故本题答案为B。
A项：单独行文指由一个机关发文。
C项：越级行文指越过直属机关行文，越级行文应同时抄送被越过的机关。
D项：多级行文指将公文同时发送给上几级或下几级机关，甚至直达基层与人民群众直接见面。